Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GINS3Q9BRX5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GINS3Q9BRX5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GINS3Q9BRX5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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