Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GORASP1Q9BQQ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms