Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECSITQ9BQ95 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms