Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD5Q99666 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD5Q99666 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms