Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT140Q96RY7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms