Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms