Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms