Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms