Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms