Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms