Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms