Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms