Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms