Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms