Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC51Q96ER9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms