Protein–RNA interactions for Protein: Q96DR5

BPIFA2, BPI fold-containing family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA2Q96DR5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA2Q96DR5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA2Q96DR5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA2Q96DR5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA2Q96DR5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA2Q96DR5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPIFA2Q96DR5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms