Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms