Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms