Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms