Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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