Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX54Q8TDD1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms