Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms