Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms