Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms