Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms