Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRCQ7RTU9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms