Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL4Q6ZR62 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms