Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms