Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms