Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBR1LQ6UX01 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms