Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms