Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFWD3Q6PCD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms