Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms