Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms