Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms