Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms