Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms