Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms