Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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