Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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