Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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