Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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E2F4Q16254 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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