Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ZNF56Q15929 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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