Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITSN1Q15811 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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