Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A5Q15758 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A5Q15758 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms