Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms