Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms