Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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