Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RABEP1Q15276 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RABEP1Q15276 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RABEP1Q15276 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RABEP1Q15276 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RABEP1Q15276 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABEP1Q15276 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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