Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATXN7L3Q14CW9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms